根據商標法規定，在簽訂許可合同后的三個月內應當到商標局進行備案，但是商標使用許可合同如不經商標局進行備案，根據最高人民法院《關于審理商標民事糾紛案件適用法律若干問題的解釋》的規定，商標許可合同未經備案的，不影響該許可合同的效力，但不得對抗善意第三人。

合同許可方式分為三種：獨占許可，排他許可和普通許可。

獨占許可是指甲方（許可人）將該商標只許可給乙方（被許可人）獨自使用，甲方約定不得使用該注冊商標。

排他許可是指甲方（許可人）將該商標許可給乙方（被許可人）使用，甲方約定可以使用該商標但不可另行再許可他人使用該商標。

普通許可是指甲方（許可人）將該商標許可給乙方（被許可人）使用，甲方約定可以使用該商標，也可以許可他人使用其注冊商標。

什么叫做不得對抗善意第三人，舉例說明：

比如：甲方為商標專有人，甲乙雙方簽訂了許可合同，但不久，甲方與丙方（丙方在毫不知情甲乙雙方許可合同的情況下）簽署了商標轉讓合同，并且該轉讓合同已在商標局進行了登記并核準，此時，對于善意的丙方，乙方不能以其在先商標許可權利進行對抗，只能追究甲方的違約責任。

比如：甲方為商標專有人，甲乙雙方簽訂了許可合同，并沒有備案，但不久甲方與丙方（丙方在毫不知情甲乙雙方許可合同的情況下）簽署了商標排他許可合同并進行了備案，那么丙方將享有該商標的排他許可合同效力，而乙方不得對抗丙方的權力，只能追究甲方的違約責任。

所以對于商標許可，被許可人一定要求許可合同需要到商標局進行備案，這也是保障被許可人的一種合法權益。